TẠP CHÍ KHOA HỌC YERSIN

YERSIN JOURNAL OF SCIENCE

ISSN: 2525 - 2372

Phân lập vi khuẩn nội sinh có tính kháng khuẩn trong cây cỏ hôi (Ageratum Conyzoides L.) ở tỉnh Sóc Trăng

  • File: Tải bài viết
  • Title: Isolation of antimicrobial endophytic bacteria in billygoat weed (Ageratum conyzoides L.) collected in Soc Trang province
  • Ngày nhận bài: 01/05/2020
  • Ngày xét duyệt: 01/06/2020
  • Ngày xuất bản: 01/07/2020
  • Tác giả: Nguyễn Phúc Huy
  • Trang: 30 - 41

Tóm tắt

Cỏ hôi (Ageratum conyzoides L.) thuộc họ Cúc (Asteraceae) được biết đến như một loại dược liệu quý có tính kháng khuẩn mạnh, nhưng các nghiên cứu trước đây chỉ sử dụng dịch trích mà chưa quan tâm nhiều đến tập đoàn vi khuẩn nội sinh trong cây. Việc tìm nguồn kháng sinh tự nhiên mới thay thế kháng sinh tổng hợp trở nên cấp bách hơn bao giờ hết, khi nhiều loại kháng sinh tổng hợp tạo ra vi khuẩn kháng sinh. Chính vì vậy, việc phân lập các dòng vi khuẩn nội sinh có tính kháng khuẩn trong cây cỏ hôi được thực hiện. Từ năm mẫu cỏ hôi thu tại tỉnh Sóc Trăng đã phân lập được 45 dòng vi khuẩn trên môi trường PDA đặc. Phần lớn các dòng vi khuẩn đều có dạng hình que, Gram âm và có khả năng di động. Khảo sát khả năng kháng với 3 loài  vi khuẩn gây bệnh bằng phương pháp khuếch tán qua giấy lọc. Kết quả có 31 dòng kháng E. coli, 29 dòng kháng Aeromonas hydrophila và 30 dòng kháng Staphylococcus aureus. Điều đáng ngạc nhiên là, có đến 20 dòng kháng được cả ba loài vi khuẩn gây bệnh và 12 dòng kháng được hai trong số ba loài gây bệnh được khảo sát. Qua nghiên cứu cũng xác định mật số kháng khuẩn hiệu quả của một số loài triển vọng. Tuyển chọn ba dòng HR10, HT18 và HL1 có hiệu quả kháng khuẩn tốt nhất, kết hợp với các đặc tính sinh hóa tiến hành định danh bằng kỹ thuật sinh học phân tử. Ba dòng HR10, HT18 và HL1 được nhận diện lần lượt là Bacillus amyloliquefaciens strain NBRC 15535, Pseudomonas oryzihabitans strain NBRC 102199Pseudomonas aeruginosa strain DSM 50071 với độ tương đồng tương ứng 95,19%, 98,39%  và 98,56%.

Abstract

Billygoat weed (Ageratum conyzoides L.), which belongs to Asteraceae species, is known as a rare medicinal plant having high antibacterial activity; however, most of the researchers only concerned oil extraction instead of promising endophytic bacteria inside this weed.  Finding new natural antibiotic is becoming more and more urgent as synthetic antibiotics can cause antibiotic resistant bacteria. As a result, the study isolation of antimicrobial endophytic bacteria from billygoat was done. From 5 samples of billy goat in Soc Trang Province, 45 bacterial strains were isolated on solid PDA media. Most of the bacteria were in rod shape, negative gram, and motile. The experiment of testing antimicrobial ability was done with the disk diffusion test method. In brief, 31 bacterial strains were resistant to E. coli, 29 bacterial strains were resistant to Aeromonas hydrophila and 30 bacterial strains were resistant to Staphylococcus aureus. Surprisingly, there were 20 bacterial strains which were resistant to all 3 harmful bacteria and 12 bacterial strains which were resistant to 2 harmful bacteria. Moreover, 3 bacterial strains, including HR10, HT18, and HL1, had the highest resistance to harmful bacteria. By the combination of chemical, biological properties and identification by molecular biology technique, 3 bacterial strains including  HR10, HT18, and HL1 were identified as Bacillus amyloliquefaciens strain NBRC 15535, Pseudomonas oryzihabitans strain NBRC 102199, Pseudomonas aeruginosa strain DSM 50071 with the identity of 95,19%, 98,39%, and 98,56%  respectively.

Từ khóa

Ageratum conyzoides, Bacillus amyloliquefaciens, kháng khuẩn, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas oryzihabitans, vi khuẩn nội sinh

Tài liệu tham khảo

Atlas RM (2010). Handbook of Microbiological Media. 4th edition. CRC Press. 1953 pages. New York, USA.

Alvarez F, Castro M,  Principe A, Borioli G, Fischer S, Mori G, Jofre E  (2012). The plantassociated Bacillus amyloliquefaciens strains MEP2 18 and ARP2 3 capable of producing the cyclic lipopeptides iturin or surfactin and fengycin are effective in biocontrol of sclerotinia stem rot disease. J Appl Microbiol, 112159-174

Bauer AW, Kirby WMM, Sherris JC, Turck M (1966). Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disk method. Amer. J. Clin. Pathol., 45: 493-496.

Fitriani A, Ihsan F, Hamdiyati Y, Maemunah (2015). Antibacterial Activity of Shewanella and Pseudomonas as Endophytic Bacteria from the Root of Ageratum conyzoides L. Asian Journal of Applied Sciences. 3(3).

Hardoim PR, Van Overbeek LS, Van Elsas JD (2008). Properties of bacterial endophytes and their proposed role in plant growth. Trends in Microbiology, 16: 463-471.

Krishnan HB, Kang BR, Krishnan AM, Kim KY, Kim YC (2007). Rhizobium elti USDA9032 engineered to produce a phenazine antibiotic inhibits the growth of fungal pathogens but is impaired in symbiotic performance. Appl. Environ. Microbiol. 73(1):327-30.

Lane DJ (1991). 16S/23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics. Stackebrandt, E. and Goodfellow, M., (Eds). John Wiley and Sons, New York, NY: pp.115-175.

Lê Minh Học, Nguyễn Hữu Hiệp (2017). Phân lập, tuyển chọn và định danh được một số dòng vi khuẩn sống nội sinh trong cây cỏ hôi (Ageratum conyzoides L.) có khả năng kháng khuẩn tại tỉnh Bạc Liêu. Luận văn Đại học. Trường Đại học Cần Thơ. Thành phố Cần Thơ.

Lee JY, Moon SS, Hwang BK (2003). Isolation and in vitro and in vivo activity against Phytophtora capsici and Colletotrichum orbiculare of Phenazine-1-carboxylicacid from Pseudomonas aeruginosa strain GC-B26. J Pest Manage. Sci. 59:872-82.

Trịnh Thành Trung, Phan Lạc Dũng, Trần Thị Lệ Quyên, Dương Văn Hợp, Đào Thị Lương, (2013). Đặc điểm sinh học và tiềm năng ứng dụng của chủng vi khuẩn Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum sp 1901 phân lập tại Rừng Quốc gia Hoàng Liên. Tạp chí Khoa học ĐHQGHN, Khoa học Tự nhiên và Công nghệ, 29 (3):59-70.

Veselova A, Klein SH, Bass IA, Lipasova VA, Metlitskaya AZ, Ovadis MI, Chernin LS, Khmel IA (2008). Quorum Sensing Systems of Regulation, Synthesis of Phenazine Antibiotics, and Antifungal Activity in Rhizospheric Bacterium Pseudomonas chlororaphis 449. Rus. J. Genetics.44:1400-8.

Zahir I, Houari A, Saad IK (2016). Antibacterial Effect of Pseudomonas aeruginosa isolated from a Moroccan hot spring discharge and partial purification of its extract. British Biotechnology Journal. 4(10): 1123-1140.

Đăng ký/Đăng Nhập
Tìm kiếm